|
USEARCH | 序列分析软件培训 |
|
班级人数--热线:4008699035 手机:15921673576( 微信同号) |
增加互动环节,
保障培训效果,坚持小班授课,每个班级的人数限3到5人,超过限定人数,安排到下一期进行学习。 |
授课地点及时间 |
上课地点:【上海】:同济大学(沪西)/新城金郡商务楼(11号线白银路站) 【深圳分部】:电影大厦(地铁一号线大剧院站)/深圳大学成教院 【北京分部】:北京中山学院/福鑫大楼 【南京分部】:金港大厦(和燕路) 【武汉分部】:佳源大厦(高新二路) 【成都分部】:领馆区1号(中和大道) 【广州分部】:广粮大厦 【西安分部】:协同大厦 【沈阳分部】:沈阳理工大学/六宅臻品 【郑州分部】:郑州大学/锦华大厦 【石家庄分部】:河北科技大学/瑞景大厦
开班时间(连续班/晚班/周末班):2020年6月15日 |
课时 |
◆资深工程师授课
☆注重质量
☆边讲边练
☆若学员成绩达到合格及以上水平,将获得免费推荐工作的机会
★查看实验设备详情,请点击此处★ |
质量以及保障 |
☆
1、如有部分内容理解不透或消化不好,可免费在以后培训班中重听;
☆ 2、在课程结束之后,授课老师会留给学员手机和E-mail,免费提供半年的课程技术支持,以便保证培训后的继续消化;
☆3、合格的学员可享受免费推荐就业机会。
☆4、实战授课。 |
☆课程大纲☆ |
|
- Geneious是一款综合、跨平台的生物信息学软件,包括操作、发现、共享和探索生物数据,例如DNA序列或蛋白质,系统进化,三维结构信息,出版文献等。它的功能包括序列对比和系统学分析,毗连群,引物设计和克隆和限制性分析,使用NCBI和EMBL,BLAST,蛋白质结构查看,自动化医学搜索等。它甚至包含了一个API,您可以创建您的个人生物信息插件。
-
- Geneious主要功能:
-
- 1. NGS分析和基因组学
- 使用行业领先的算法,包括TopHat和Velvet,Illumina、PacBio或Torrent读数(任何长度、成对端、条形码)的从头组装或参考映射。对数据的综合分析,包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式。
-
-
- 2. 序列图和色谱分析
- 修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件,正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。
-
-
- 3. 对齐和树构建
- 使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和突出显示。使用包括RAxML和PAUP在内的同行评审算法构建系统树,并为公开准备的图形调整显示设置。
-
- 4. 分子克隆
- 查看质粒图,自动注释矢量并用注释复制粘贴序列。寻找限制站点、消化、连接和执行Golden Gate,Gibson和Gateway克隆。设计引物,找到CRISPR站点并优化密码。在克隆过程中跟踪历史和亲子后代谱系。
-
-
- 5. 搜索、共享和自动化
- 针对NCBI进行批量BLAST,并直接搜索GenBank。使用无缝集成的共享库集中和协作数据。导入和导出大多数行业标准文件格式。建立自动化的工作流程,以提高效率,控制业务流程,并减少您的研究中的人为错误。
-
-
- 6. SnapGene文件导入
- 将SnapGene*.gna序列文件拖放到Geneious中,无缝地导入序列及其注释和其他元数据。
-
- 7. CRISPR-CPF1特异性评分
- 自信地选择理想的CRISPR-CPF1引导RNA位点使用新的特异性评分,这是根据对您选择的数据库的非目标分析计算出来的。
-
- 8. 智能NGS导入
- 只需一个简单的步骤就可以将任何类型的SAM、GFF、BED和VCF文件拖放到Geneious中,即使您有不同的样品和参考序列的混合物。
-
- 9. CRISPR Cpf1选项
- 添加了CRISPR-CPF1与5' PAM位点的支持。在A和T丰富序列中找到位点,并在体内具有更高的裂解效率。
-
- 10. RNA-Seq表达分析的火山图
- 在交互式火山图中可视化基因表达,可以用来突出和跳转到差异表达基因。
-
- 11. 限制性位点无表型突变分析
- 自动识别在不影响蛋白质的情况下引入限制位点的编码序列中的点突变。
-
- 12. 漂亮的PCA图
- 具有更好的标签和新的可视化选项,创建漂亮的PCA图形。
-
- 13. 创建酶制剂
- 不再从其他来源获取信息。现在您可以很容易地创建您自己的酶组。
-
- 14. 更好的FASTQ导入功能
- 在导入过程中,成对读取可以相互关联,而Geneious会猜出它们是如何配对的。还可以设置读取技术。
-
- 15. 为细菌基因组比对更新Mauve插件
- 现在包括对序列列表的支持和用于重新排序重叠群的MCM操作,使draft基因组对齐和进行基因组整理成为可能。
-
- 16. 更好的BLAST服务器管理
- 一次设置多个BLAST服务器镜像,每次搜索时,选择优秀的一个。不用每次切换镜像。
-
- 17. NCBI BLAST云支持
- 有了NCBI BLAST云之后,设置您自己的BLAST镜像变得更为简单。如果您以这种方式创建一个镜像,Geneious可以与它连接起来。
-
- 18. 按索引连接
- 连接序列列表并按索引对齐,而不是按照名称对齐,这对于合并不完全重叠的成对读取非常有用。
-
- 19. 序列列表的CSV/TSV导出
- 将序列表中的所有序列连同它们的元数据一起导出到CSV/TSV中,这样您就可以将它们放在Excel中或类似的情况下进行进一步的分析。
-
- What's New in Geneious Prime 2019?
- The Geneious Prime 2019 release is here. Geneious Prime 2019 is free if you have a valid subscription or a perpetual version Prime 2019 license. If you are currently using a previous version-only licence (eg R11), you will have to purchase an upgrade.
-
- We have changed the way we refer to the new versions of Geneious with this release being called Geneious Prime 2019 instead of Geneious R12. This will make it easier for you to know that you are on the latest version. Please visit Geneious Prime for further details of the recent name change.
- Have an older version of Geneious Prime? The software that you know and love gets better every year. Upgrade now and you can enjoy Geneious Prime 2019 as well as all the features included in previous releases.
-
- Geneious Prime 2019 Festures and Benefits:
-
- Custom Codon Usage Tables
- Back translate and optimize codons using your own codon usage tables. Import standard formats from public databases or external codon analysis tools.
-
- Rapid Manual Primer Design
- Select desired binding site in the Sequence View to see real-time display of length and melting point (Tm)then easily add a primer annotation with a convenient new button.
-
- Powerful Primer Annotation Display
- 5' extensions (tails) on annotated primers are now displayed inside the sequence view to indicate the length of the extension, the nucleotides it contains and what functional elements are present such as restriction sites, spacers and tags.
-
- Simplified Testing and Annotation of Existing Primers
- Easily search all folders for primers that match a sequence of interest with the redesigned "Test with Saved Primers" operation. Copy and paste primers from other programs into the new "Add Primers" operation to find them on your target sequence in one step.
-
- Drag and Drop Sequence Export
- Export annotated sequences in GenBank format by simply dragging documents out of Geneious Prime and onto the desktop or into another program.
-
- Easy Extraction of PCR and Restriction Digest Products
- Shift click between two compatible primers or restriction enzymes for quick and easy extraction of their product from your sequence.
-
- Improved Protein Statistics
- Calculate on the fly statistics for protein sequences directly on nucleotide sequences within the Statistics panel, with new protein statistics added including charge at pH 7 and amino acid group counts.
-
- Improved GenBank Export
- Export the information you need with your sequences using the simplified, flexible options to include your own Meta-Data fields and allow or constrain export parameters to suit downstream applications.
-
- Publish Plugins via Internal Network
- Create a curated list of plugins to offer privately to members of your organization via your internal network.
-
- Usability Tweaks to Increase Efficiency
- Enjoy an improved table of primers, drag and drop backbone selection for cloning, easier workflow management, better defaults, a less cluttered Sequence View and many other little tweaks and improvements.
|
|
|
|
合作伙伴与授权机构 |
Altera全球合作培训机构
|
诺基亚Symbian公司授权培训中心 |
Atmel公司全球战略合作伙伴
|
微软全球嵌入式培训合作伙伴 |
英国ARM公司授权培训中心 |
ARM工具关键合作单位 |
|
|
|
我们培训过的企业客户评价: |
端海的andriod 系统与应用培训完全符合了我公司的要求,达到了我公司培训的目的。
特别值得一提的是授课讲师针对我们公司的开发的项目专门提供了一些很好程序的源代码, 基本满足了我们的项目要求。
——上海贝尔,李工
端海培训DSP2000的老师,上课思路清晰,口齿清楚,由浅入深,重点突出,培训效果是不错的,
达到了我们想要的效果,希望继续合作下去。
——中国电子科技集团技术部主任 马工
端海的FPGA 培训很好地填补了高校FPGA培训空白,不错。总之,有利于学生的发展,
有利于教师的发展,有利于课程的发展,有利于社会的发展。
——上海电子学院,冯老师
端海给我们公司提供的Dsp6000培训,符合我们项目的开发要求,解决了很多困惑我
们很久的问题,与端海的合作非常愉快。
——公安部第三研究所,项目部负责人李先生
MTK培训-我在网上找了很久,就是找不到。在端海居然有MTK驱动的培训,老师经验
很丰富,知识面很广。下一个还想培训IPHONE苹果手机。跟他们合作很愉快,老师很有人情味,态度很和蔼。
——台湾双扬科技,研发处经理,杨先生
端海对我们公司的iPhone培训,实验项目很多,确实学到了东西。受益无穷
啊!特别是对于那种正在开发项目的,确实是物超所值。
——台湾欧泽科技,张工
通过参加Symbian培训,再做Symbian相关的项目感觉更加得心应手了,理
论加实践的授课方式,很有针对性,非常的适合我们。学完之后,很轻松的就完成了我们的项目。
——IBM公司,沈经理
有端海这样的DSP开发培训单位,是教育行业的财富,听了他们的课,茅塞顿开。
——上海医疗器械高等学校,罗老师
|
我们最新培训过的企业客户以及培训的主要内容: |
|
一汽海马汽车 DSP培训
苏州金属研究院 DSP培训
南京南瑞集团技术 FPGA培训
西安爱生技术集团 FPGA培训,DSP培训
成都熊谷加世电气 DSP培训
福斯赛诺分析仪器(苏州) FPGA培训
南京国电工程 FPGA培训
北京环境特性研究所 达芬奇培训
中国科学院微系统与信息技术研究所 FPGA高级培训
重庆网视只能流技术开发 达芬奇培训
无锡力芯微电子股份 IC电磁兼容
河北科学院研究所 FPGA培训
上海微小卫星工程中心 DSP培训
广州航天航空 POWERPC培训
桂林航天工学院 DSP培训
江苏五维电子科技 达芬奇培训
无锡步进电机自动控制技术 DSP培训
江门市安利电源工程 DSP培训
长江力伟股份 CADENCE 培训
爱普生科技(无锡 ) 数字模拟电路
河南平高 电气 DSP培训
中国航天员科研训练中心 A/D仿真
常州易控汽车电子 WINDOWS驱动培训
南通大学 DSP培训
上海集成电路研发中心 达芬奇培训
北京瑞志合众科技 WINDOWS驱动培训
江苏金智科技股份 FPGA高级培训
中国重工第710研究所 FPGA高级培训
芜湖伯特利汽车安全系统 DSP培训
厦门中智能软件技术 Android培训
上海科慢车辆部件系统EMC培训
中国电子科技集团第五十研究所,软件无线电培训
苏州浩克系统科技 FPGA培训
上海申达自动防范系统 FPGA培训
四川长虹佳华信息 MTK培训
公安部第三研究所--FPGA初中高技术开发培训以及DSP达芬奇芯片视频、图像处理技术培训
上海电子信息职业技术学院--FPGA高级开发技术培训
上海点逸网络科技有限公司--3G手机ANDROID应用和系统开发技术培训
格科微电子有限公司--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
南昌航空大学--fpga 高级开发技术培训
IBM 公司--3G手机ANDROID系统和应用技术开发培训
上海贝尔--3G手机ANDROID系统和应用技术开发培训
中国双飞--Vxworks 应用和BSP开发技术培训
|
上海水务建设工程有限公司--Alter/Xilinx FPGA应用开发技术培训
恩法半导体科技--Allegro Candence PCB 仿真和信号完整性技术培训
中国计量学院--3G手机ANDROID应用和系统开发技术培训
冠捷科技--FPGA芯片设计技术培训
芬尼克兹节能设备--FPGA高级技术开发培训
川奇光电--3G手机ANDROID系统和应用技术开发培训
东华大学--Dsp6000系统开发技术培训
上海理工大学--FPGA高级开发技术培训
同济大学--Dsp6000图像/视频处理技术培训
上海医疗器械高等专科学校--Dsp6000图像/视频处理技术培训
中航工业无线电电子研究所--Vxworks 应用和BSP开发技术培训
北京交通大学--Powerpc开发技术培训
浙江理工大学--Dsp6000图像/视频处理技术培训
台湾双阳科技股份有限公司--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
滚石移动--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
冠捷半导体--Linux系统开发技术培训
奥波--CortexM3+uC/OS开发技术培训
迅时通信--WinCE应用与驱动开发技术培训
海鹰医疗电子系统--DSP6000图像处理技术培训
博耀科技--Linux系统开发技术培训
华路时代信息技术--VxWorks BSP开发技术培训
台湾欧泽科技--iPhone开发技术培训
宝康电子--Allegro Candence PCB 仿真和信号完整性技术培训
上海天能电子有限公司--Allegro Candence PCB 仿真和信号完整性技术培训
上海亨通光电科技有限公司--andriod应用和系统移植技术培训
上海智搜文化传播有限公司--Symbian开发培训
先先信息科技有限公司--brew 手机开发技术培训
鼎捷集团--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
傲然科技--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
中软国际--Linux系统开发技术培训
龙旗控股集团--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
研祥智能股份有限公司--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
罗氏诊断--Linux应用开发技术培训
西东控制集团--DSP2000应用技术及DSP2000在光伏并网发电中的应用与开发
科大讯飞--MTK应用(MMI)和驱动开发技术培训
东北农业大学--IPHONE 苹果应用开发技术培训
中国电子科技集团--Dsp2000系统和应用开发技术培训
中国船舶重工集团--Dsp2000系统开发技术培训
晶方半导体--FPGA初中高技术培训
肯特智能仪器有限公司--FPGA初中高技术培训
哈尔滨大学--IPHONE 苹果应用开发技术培训
昆明电器科学研究所--Dsp2000系统开发技术
奇瑞汽车股份--单片机应用开发技术培训
|
|
|
|
|